Выше уже говорилось, что в окрестностях Тушина на покровных безвалунных глинах и суглинках, то есть в пределах плоского водораздельного пространства, в далёком прошлом росли смешанные леса с преобладанием ели. Ели было особенно много в пределах моренных равнин, а на флювиоляциальных равнинах могла возрастать доля сосны. Ещё больше сосны должно было быть на третьей надпойменной террасе реки Москвы. Такой хвойный лес долгое время преобладал на всей территории будущего Тушина, и только вдоль речек и ручейков тянулись узкие полоски сероольшаников или ивняков.
По мере развития земледелия и животноводства, среди лесов стали появляться пашни, пастбища и косимые луга, то есть открытые пространства с преобладанием травянистой растительности. Некоторые из таких участков зарастали вторичным лесом - березняками, осинниками, на месте которых постепенно начинал восстанавливаться исходный лес. Человек, таким образом, "запускал" процесс смены растительных сообществ - антропогенную сукцессию. Разные участки находились на разных стадиях развития, и природа в целом оказывалась разнообразнее, чем до вмешательства человека. Мы достоверно не знаем, какими были в то или иное время те или иные участки леса вблизи Тушина, но ещё в начале ХХ века, судя по старым картам, лесов в этой местности было почти так же много, как открытых пространств. Самый большой лесной массив находился между Петровом, Захарковом и Алёшкином (между нынешними улицами Туристская, Героев Панфиловцев и бульваром Яна Райниса, а также вдоль улиц Аэродромная и Фомичёвой). Он узкой перемычкой соединялся с сохранившимся Алёшкинским лесом (севернее ул. Вилиса Лациса). Другой лесной массив занимал пространство между нынешними улицами Лодочная и Фабрициуса, а также находился в районе Цветочного проезда. Лес был также на дне Тушинской Чаши и выходил за её пределы на юго-восток к современному Строительному проезду. Безлесыми были пространства вокруг Братцева (на северо-восток до Алёшкинского леса, на юго-восток - до Тушинской Чаши), вблизи Захаркова (вверх и вниз по речке Химке) и везде около старого Тушина (нынешний Тушинский аэродром и район Тушинских проездов).
В настоящее время, как уже говорилось, из крупных лесных массивов сохранился только Алёшкинский лес. Он расположен в северной части описываемой территории между Московской кольцевой автодорогой и улицей Вилиса Лациса. Здесь преобладают саженые сосняки. Есть также дубняки, березняки, осинники, сероольшаники. Лес пересекает глубокая и живописная долина речки Братовки, постоянное течение которой начинается именно здесь. Слева к Братовке подходит довольно большая залесенная балка. В качестве участка широколиственного леса можно рассматривать также парк в Братцеве. Для него характерен, в частности, ясень высокий, который в Москве в целом сравнительно редок, а в Братцеве имеется в большом количестве и даёт многочисленный жизнеспособный подрост. Кроме того, тут произрастают липа, клён остролистный, два вида берёзы, ольха серая, рябина, черёмуха, вяз, клён американский, тополя, сосна, лиственница. Имеются также перелески на склонах Тушинской Чаши, но в них преобладают деревья, чуждые местной флоре: ясень пенсильванский, клён американский, тополя. На дне Тушинской Чаши есть берёзовые перелески. Вдоль реки Сходни во многих местах тянутся живописные ряды ракит, образуя подобие "галерейного" леса.
Увеличению ландшафтного разнообразия способствовали также торфоразработки нескольких последних веков, на месте которых потом оставались заполненные водой торфяные карьеры. Они постепенно затягивались болотными травами, превращались в болота. Если эти болота были на водоразделах и не имели связи с грунтовыми водами, на них сплошным ковром разрастался белёсый мох сфагнум, а на нём - его постоянные спутники: пушица влагалищная, росянка, некоторые виды осок и кустарнички из семейства вересковых. Остаток такого болота сохранился в Алёшкинском лесу около пересечения улицы Свободы и МКАД, в точности на водоразделе рек Сходня и Химка. Болото почти полностью заросло лесом, но ещё до сих пор под пологом деревьев и кустов в одном месте сохраняются клюква и пушица влагалищная. Клюква внутри МКАД осталась только здесь, а данный вид пушицы - всего в нескольких точках. В 1999 году одним из авторов брошюры тут наблюдался один небольшой кустик болотного мирта -последний кустик этого верескового кустарничка внутри МКАД! В 1986 году московский ботаник Валентина Александровна Романова, кроме клюквы, пушицы и болотного мирта, нашла на этом болотце также осоку топяную - специфический вид осоки, характерный для верховых болот.
В более отдалённом прошлом водораздельных болот в Тушине было больше. В гербарии Московского университета есть образцы осок топяной и пушистоплодной, росянки круглолистной и подбела из окрестностей Захаркова, собранные известным ботаником Н.Н.Кауфманом в 1863-1867 годах. Примерно в это же время вблизи Захаркова наблюдался багульник. Есть также указание И.Н.Горожанкина на наличие голубики в 1872 году "между Иванковым и Петровским оврагом", то есть тоже на водоразделе Сходни и Химки вблизи Захаркова, но не севернее его (в Алёшкинском лесу), а юго-западнее. Значит, верховое болото находилось здесь. Вероятно, его и имел ввиду Н.Н.Кауфман, когда говорил о болоте вблизи Захаркова.
В настоящее время в Тушине имеются также примечательные низинные болота. Все они находятся на дне Тушинской Чаши. Центральное болото отделено от северной петли реки Сходни лугом и группами ивовых кустов. На большей его части доминирует хвощ речной, местами - рогоз широколистный и другие виды обычных болотных трав. Из особо охраняемых видов имеются горец змеиный (раковые шейки) и пальчатокоренник мясо-красный (растение из семейства орхидных). Горец змеиный тяготеет к луговым окраинам болота и местами произрастает в массе. Пальчатокоренник отмечен в числе не менее 15 экземпляров. К числу интересных растений можно отнести также пушицу многоколосковую, которая может произрастать и на верховых, и на низинных болотах. Восточное болото обладает примерно тем же видовым составом трав, что и центральное. Оба они питаются родниковыми водами, сбегающими в них ручейками со склонов Тушинской Чаши (ключевые болота). Западное болото меньше по площади и беднее во флористическом отношении. Из охраняемых видов найден только горец змеиный.
Есть в Тушине и примечательные луговые участки. Высокотравные злаковые луга тянутся вдоль речки Братовки, в виде небольших фрагментов имеются вдоль Химкинского водохранилища и в других местах. Но, наверное, самый интересный из луговых объектов - это крутой берег реки Москвы ниже МКАД. Здесь на южном склоне, который хорошо прогревается солнцем, в большом количестве произрастают пупавка красильная, синеголовник плосколистный, душица обыкновенная и другие травы, характерные для сухих остепнённых лугов. Эти же виды встречаются кое-где вдоль реки Сходни и вдоль Рижской железной дороги на таких же склонах. Пупавку иногда называют "жёлтой ромашкой", и узнавание её не представляет никаких трудностей. Синеголовник - обладатель "говорящего названия", и его синие плотные головки, окружённые колючими листочками обёртки, тоже трудно с чем-либо спутать. Маленькие розовые цветки душицы собраны в крупную щитковидную метёлку и потому заметны издалека. Всё растение очень пахучее, душистое. Его латинское название "ориганум" дословно переводится как "гороукрашение".